Autre hypothèse que nous citons pour être complet, mais qui nous paraît moins vraisemblable, le nom d'un ancien métier
Ainsi, selon
le "Dictionnaire des noms de famille de France et d'ailleurs", le nom MERNIER dériverait d'un nom de métier, celui de "mairenier", "mairnier", "merenier" ou "merrenier": 

"Porté dans les Ardennes et en Belgique, c'est une variante de l'ancien français 'mairenier'."
( http://www.geneanet.org/onomastique/index.php3?nom=Mernier

"Les mairniers étaient les marchands de bois de construction ronds, carrés ou fendus. Venant par flottaison sur la Meuse ou l'Ourthe, les bois étaient débarqués sur le rivage de l'actuel quai sur Meuse. Les ouvriers recevaient ainsi le bois brut et étaient chargés de le dégrossir. Cette tâche était réalisée par des scieurs, des équarrisseurs, des faiseurs de lattes et des haveurs. Fabrice Muller -  Les 32 bons métiers

Au Moyen-Age, à Liège, les mairniers constituent une des 32 corporations de métiers. 

Le blason de cette corporation est repris sur le vitrail des "32 Bons Métiers de la Cité de Liège" dans l'église Saint-Jacques-le-Mineur:

 http://www.fabrice-muller.be/sj/vues/vitrail-1.html .

Cette origine nous paraît cependant peu vraisemblable car, d'une part l'usage de ce nom ne serait pas concentré dans une zone géographique, mais se rencontrerait dans un ensemble beaucoup plus vaste et, d'autre part,  on n'aurait pas utilisé la préposition "de", mais plutôt l'article "le" devant le nom.

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